Jovovich 2009 óta alkot egy párt Paul W. S. Anderson, rendezővel, össze is házasodtak. Két közös lányuk van. A színésznő anno azért árulta el féltve eddig féltve örzött titkát, mert így akar tiltakozni az ellen, hogy az USA-ban már a hatodik államban is tiltott abortuszon átesni akkor is, ha nemi erőszak vagy vérfertőzés áldozata a kismama.